Ressources
-
STORM Therapeutics: From Lead to Pre-Candidate Nomination in 18 Months
STORM Therapeutics: From Lead to Pre-Candidate Nomination in 18 Months
Case study
Solutions scientifiques | Conception de médicaments assistée par ordinateur
Simulations de dynamique moléculaire
Nous transformons les mouvements moléculaires en informations exploitables pour une compréhension plus complète des systèmes cibles. Grâce à nos technologies de pointe et à nos logiciels propriétaires, nous vous aidons à révéler des interactions cachées, à prédire la stabilité des ligands et à faire des choix de conception éclairés qui accélèrent votre programme de découverte de médicaments.
soutenir vos recherches
Identifier les interactions clés n’est pas toujours simple. Les modèles statiques peuvent passer à côté de dynamiques essentielles influençant la liaison et la stabilité. Les simulations de dynamique moléculaire permettent d’observer les cibles en mouvement, de révéler des interactions cachées et d’améliorer les stratégies de conception moléculaire.
Notre équipe bénéficie d’une longue expérience dans l’application de la médecine nucléaire à diverses classes de cibles et modalités, grâce à des technologies de pointe et au cloud computing sécurisé. Des trajectoires courtes aux systèmes membranaires complexes, nous conjuguons excellence technique et puissance de calcul.
Grâce à des protocoles avancés comme SygProbe, notre approche exclusive de dynamique moléculaire en solvants mixtes, nous cartographions les sites de liaison afin d’identifier les régions favorisant les interactions lipophiles ou polaires. Ces informations permettent une optimisation plus efficace des composés.
Notre approche
Plateforme Orion pour des simulations évolutives dans le cloud :
- Dynamique moléculaire à trajectoire courte (STMD) pour des évaluations rapides de liaison
- Détection de poches cryptiques pour révéler des opportunités cachées
- Commutation hors équilibre (NES) pour les calculs avancés d’énergie libre
Cluster de calcul Sygnature :
- Membrane MD exclusive avec composition lipidique sur mesure
- Molécule de MD à solvant mixte exclusive (SygProbe) pour l’étude de la polarité des sites de liaison
- Moteurs standards de l’industrie : GROMACS, OpenMM/OpenFF
Pourquoi choisir Sygnature Discovery ?
Nous ne nous contentons pas de réaliser des simulations ; nous intégrons les enseignements de la dynamique moléculaire aux décisions de synthèse concrètes. Notre équipe d’experts conjugue des années d’expérience dans de multiples classes de cibles et modalités, avec un accès aux technologies les plus récentes et à un cloud computing sécurisé.
Notre cluster de calcul haute performance exclusif, qui alimente des outils internes tels que la dynamique moléculaire en solvant mixte et la dynamique moléculaire membranaire, permet des prédictions plus rapides et plus précises de la stabilité des ligands et de la qualité de liaison. Qu’il s’agisse de détecter des poches cryptiques ou de modéliser les RCPG dans les membranes, nous vous aidons à faire des choix de conception éclairés qui accélèrent la découverte.
Centre de ressources
Recherches et ressources connexes
No posts found.
Capacités connexes
Nous vous aidons à concevoir des composés plus intelligents et à prendre des décisions plus rapidement en combinant la modélisation basée sur l’IA, une vaste expertise scientifique et un accès sécurisé et collaboratif aux données pour résoudre des problèmes complexes et accélérer votre processus de découverte de médicaments.
Prédiction de la structure des protéines
L’utilisation d’une IA avancée et de techniques de modélisation éprouvées permet de prédire avec précision les structures protéiques, accélérant ainsi la conception de médicaments basée sur la structure et la découverte de nouvelles thérapies.
possibilités.
Prédiction ternaire des protéines
Nous vous aidons à concevoir et à optimiser avec précision des complexes ternaires, en combinant modélisation avancée et expertise collaborative, rendant ainsi accessibles des cibles auparavant « impossibles à traiter ».
Simulations de dynamique moléculaire
Utilisation de technologies de pointe et de logiciels propriétaires pour découvrir des interactions cachées, prédire la stabilité des ligands et faire des choix de conception éclairés qui accélèrent votre programme de découverte de médicaments.
Intelligence artificielle générative et apprentissage automatique
En combinant la conception pilotée par l’IA, des modèles d’apprentissage automatique sur mesure et la bioinformatique basée sur le LLM avec une collaboration pratique, nous vous aidons à découvrir plus rapidement des candidats médicaments optimisés.
dépistage virtuel
Identifier rapidement des composés prometteurs grâce au criblage virtuel à grande échelle, à des bibliothèques sélectionnées et à un tri par des experts afin d’accélérer les programmes de découverte de médicaments.
Analyse des cibles
Des sites de liaison à la pharmacologie, nos équipes de chimie computationnelle et de science des protéines vous aident à trouver plus rapidement les bons points de départ, en combinant une connaissance approfondie des structures avec des outils de pointe pour concevoir des composés qui font progresser votre projet en toute confiance.
Conception de médicaments basée sur les ligands
Exploiter les propriétés de molécules actives connues pour générer et optimiser rapidement de nouveaux composés grâce à des connaissances basées sur les ligands, des outils alimentés par l’IA et une expertise collaborative afin de découvrir de nouveaux espaces chimiques et d’accélérer les découvertes.
Conception de médicaments basée sur la structure
Nous vous aidons à concevoir de meilleurs composés avec une plus grande confiance. Grâce à des connaissances à l’échelle quantique et à des simulations dynamiques, nous prédisons l’affinité, guidons l’optimisation et vous aidons à identifier plus rapidement les candidats les plus prometteurs.
FAQ
Nos experts possèdent une expérience dans de multiples domaines cibles, notamment les kinases, les RCPG, les canaux ioniques et bien plus encore.
Nous proposons une gamme de flux de travail personnalisés, incluant la détection de poches cryptiques, la MD à courte trajectoire et le criblage virtuel. Chaque flux de travail est flexible et adapté aux besoins spécifiques de votre projet.
Nos analyses standard incluent l’analyse des interactions protéine-ligand (liaisons hydrogène, empilement π), l’analyse conformationnelle et les scores MMPBSA pondérés par la distribution de Boltzmann. Nous proposons également des analyses personnalisées telles que le suivi de distances ou de torsions spécifiques, l’analyse membranaire et l’analyse des dimensions des pores. Les fichiers de trajectoire et de topologie complets sont disponibles sur demande.
