Une nouvelle plateforme devrait accélérer la dégradation ciblée des protéines à un stade précoce.

Sygnature Discovery, société mondiale intégrée de découverte de médicaments, a dévoilé une nouvelle plateforme facilitant l’assemblage et l’examen combinatoires à haut débit de dégradeurs moléculaires ( CHARMED ), en réponse à une augmentation soutenue de la demande pour son expertise multidisciplinaire.

Qu’est-ce que la plateforme CHARMED ?

Développée en interne chez Sygnature Discovery, CHARMED est une plateforme technologique conçue pour accélérer et soutenir les programmes de dégradation ciblée des protéines (TPD) en phase précoce.

Elle offre une combinaison de chimie à haut débit, de biologie in vitro et d’essais DMPK, ainsi qu’un accès à des plaques 96 puits « prêtes à être couplées » qui tirent parti de divers connecteurs et de têtes de réaction de ligases populaires, permettant une synthèse, un criblage et une caractérisation rapides de dégradeurs bifonctionnels afin d’accélérer l’identification de composés candidats pour de nouvelles cibles.

Le Dr Simon Hirst, fondateur et PDG de Sygnature Discovery, déclare : « La plateforme CHARMED combine notre expertise interne de classe mondiale en chimie, en biologie in vitro et en DMPK avec une boîte à outils pratique qui aide les clients à accélérer leur découverte de médicaments.

Avantages de CHARMED

« Dans l’ensemble du secteur, nous constatons un intérêt considérable pour la dégradation ciblée des protéines, mais de nombreuses organisations peinent à trouver des points de départ pour leurs programmes ou des molécules possédant les propriétés adéquates pour réussir en clinique. »

« L’un des principaux défis posés par la dégradation ciblée des protéines et les molécules bifonctionnelles réside dans le fait que leurs propriétés physiques sont inhabituelles et ne respectent pas la « règle des cinq ». De ce fait, nous devons développer des technologies permettant d’évaluer ces propriétés et de les filtrer afin de sélectionner les molécules offrant les meilleurs résultats. »

« Avec la plateforme CHARMED, nous réunissons plusieurs technologies de Sygnature, en combinant nos capacités de chimie à haut débit avec la biologie à haut débit », explique Simon. « Nous soutenons la synthèse rapide de molécules bifonctionnelles grâce à une série de tests et de plateformes qui permettront d’évaluer leur potentiel pour la suite du développement. »

Le Dr Roland Hjerpe est chercheur principal en biosciences chez Sygnature Discovery et dirige les travaux sur la dégradation ciblée des protéines. Il explique : « Dans la plupart des cas, la dégradation ciblée des protéines repose sur le rapprochement d’une ligase d’ubiquitine avec une protéine cible. De ce fait, cette méthode ne nécessite pas que la protéine cible possède un site actif ou une poche de liaison fonctionnelle bien définie et accessible. Cela signifie que des méthodes de criblage par affinité, basées sur la spectrométrie de masse à sélection d’affinité (ASMS) ou sur des banques codées par ADN (DEL), peuvent être utilisées pour identifier des ligands susceptibles de se lier à n’importe quelle poche disponible sur la protéine cible. Cependant, toutes les protéines ne sont pas identiques et toutes les protéines cibles ne sont pas facilement dégradables. »

C’est là qu’intervient CHARMED : cette plateforme permet aux organisations d’évaluer rapidement la faisabilité d’un projet de dégradation de leur protéine d’intérêt à l’aide de deux des ligases les plus courantes, accélérant ainsi leur projet, réduisant les risques et les délais. Elle offre un moyen rapide de collecter des données et de sélectionner un grand nombre de molécules parmi un ensemble plus restreint. De plus, Sygnature Discovery propose l’interprétation des données et l’expertise intégrée nécessaire pour accélérer les projets.

Ce que Sygnature Discovery peut vous offrir

Le Dr Simon Hirst ajoute : « Alors que certaines organisations continuent de déléguer les différentes étapes du processus de découverte de médicaments à des CRO du monde entier, nous sommes convaincus qu’une approche plus intégrée est nettement plus efficace. Nos scientifiques expérimentés intègrent l’équipe de recherche du projet, contribuent à la résolution des problèmes et font progresser les projets. Forts d’une expérience réussie avec plus de 21 candidats cliniques à notre actif, nous possédons l’expertise nécessaire pour faire une réelle différence et maximiser les chances de succès des projets. En effet, nos équipes de chercheurs en découverte de médicaments, regroupées au sein de Sygnature Discovery, proposent une offre intégrée capable de mener un projet de l’identification de la cible jusqu’à l’obtention d’un candidat médicament expérimental (IND). »

CHARMED propose la synthèse parallèle de composés dégradeurs PROTAC bifonctionnels ; une collection en stock de nouveaux linkers et ligands de ligase pour l’optimisation des composés candidats, des tests de dégradation ^HTRF® , ^AlphaLISA® ou système Jess pour les cibles endogènes ; des tests de dégradation cinétique sur cellules vivantes modifiées et une évaluation ADME in vitro à haut débit.